Un cluster qui passe de 40 à 90 processeurs, une baie de stockage portée de 1 à 10 Teraoctets (précisions sur le matériel ici) : la plateforme bio-informatique de la Génopole Toulouse Midi-Pyrénées vient d’enclencher la vitesse supérieure en matière de moyens de calculs et de stockage. Une nécessité, alors que l’analyse des séquences de gènes se révèle toujours plus gourmande. « Auparavant, nous pouvions comparer un gène inconnu aux bases de données génomiques existantes. Grâce à nos nouvelles capacités, ce sera un génome entier que nous pourrons comparer. En l’espace de trois ans, nous sommes passés au calcul à grande échelle, souligne Christine Gaspin, responsable de la plateforme bio-informatique, une des sept plateformes de la Génopole. Les chercheurs pourront utiliser des banques de données de plus en plus importantes et faire un maximum de calculs en un temps limité. Cela donne un avantage aux laboratoires toulousains dans la compétition internationale ».

La plateforme a pour principales missions de mettre a disposition matériel et logiciels pour les laboratoires régionaux, d’appuyer les programmes de recherche en biologie et bio-informatique, et de mettre en place des formations à l’analyse des données destinées aux laboratoires publics et à quelques entreprises privées. « Actuellement, nos services sont essentiellement tournés vers les laboratoires publics, car nous n’avons pas tous les logiciels et certaines licences sont trop coûteuses, précise toutefois Christine Gaspin. Nous allons maintenant nous ouvrir vers le privé en mutualisant l’achat de ces licences avec les entreprises ».

Jean-François Haït, Mid e-News
jfhait at free.fr

* La génopole Toulouse Midi-Pyrénées est une des huit génopoles françaises créées en 1999. Elle comporte aujourd'hui 6 plateformes dont 5 technologiques (centre de ressources génomiques, séquençage et génotypage (CRGS), biopuces, protéomique, exploration physio-pathologique des animaux modèles, bioinformatique) et une plate-forme sociétale (génétique et société). Ses missions : réaliser des analyses des génomes et de leurs produits à grande échelle, assurer l'enseignement dans le domaine du génome, fédérer des laboratoires de recherche labellisés, rassembler des compétences en bio-informatique et soutenir la création d'entreprises de biotechnologies.